IBM挖掘微生物测序价值
发布时间:2014-12-02 浏览次数:1416 分享:
导读:3月份,IBM表示他们将利用其超级计算机“沃森”的云计算系统与位于纽约的基因组研究中心合作,帮助开发治疗脑胶质瘤的方案,以期战胜人类脑癌,而近期IBM表示拟通过对生活环境(农场、地铁等)中的微生物进行测序,挖掘自然环境中大量有益微生物。
2009年10月份,IBM宣布,将加入到降低个人基因组测序成本的竞争中,不仅有望将价格降低到1000美元以下,最终甚至有可能降至100美元的水平。
早在2010年1月份,IBM Thomas J. Watson实验室(Yorktown Heights, NY, USA)的计算生物中心高级经理Ajay Royyuru就对外宣传过"生物学越来越成为一种信息学科学,对于IBM而言更是一种业务",而后者正是IBM的专长所在,因此IBM计划设计发明出更快更便宜的测序技术。
也就是在当年的7月份左右,罗氏和IBM公司宣布将共同开发基于纳米孔的测序技术,拟采用IBM研发部门开发的DNA Transistor技术来快速高效地对人类DNA进行直接读取和测序。当DNA分子穿过硅芯片上纳米大小的孔时,该技术能破译DNA分子,从而实现真正的单分子测序。根据罗氏和IBM当时的说法,与其它现有测序技术或正在开发的技术相比,这项技术在费用、通量、规模和速度上都具有“重大优势”。
然而在2013年,罗氏却宣布因涉及的技术风险较高,结束了与IBM合作开发纳米孔测序平台的伙伴关系。
2013年4月9日 IBM和CLC生物信息公司将结合二者的硬件和软件产品,联合为客户提供一个高通量测序数据分析的一条龙服务平台。平台有3种不同的配置,从48个CPU和192GB内存到192个CPU和768GB内存,取决于客户的要求。
在今年的3月19日,IBM表示他们将利用其超级计算机“沃森”的云计算系统与位于纽约的基因组研究中心合作,帮助开发治疗脑胶质瘤的方案,以期战胜人类脑癌。
在4月份,各大外媒也纷纷报道IBM公司喜欢大数据,获取的越多,就越能向用户销售出更多的服务器、存储和服务,并将充分利用大数据变革医疗行业。
5月6日至7日,在IBM硅谷阿尔马登研究中心召开了“为城市测序:在大数据时代的宏基因组学”的专题研讨会。其中比较受业内人士关注的是来自全球领先的科技新闻网站CNET News中的一篇报道“IBM sees big opportunity in sequencing microbes”。文章中指出,IBM公司拟通过对生活环境(农场、地铁等)中的微生物进行测序,挖掘自然环境中大量有益微生物。
在地球这个生态系统中,存在着大量的微生物,尽管目前世界上已经建立了3000多种细菌的全基因组数据库,随着技术的开放,获取这些数据库也越来越便宜。
(来源:生物探索 由生化厂转载)