全基因组测序验证RT-qPCR结果：冷冻浆果中食源性病毒检测新进展
发布时间：2024-09-20 浏览次数：71 分享：
科技前沿
在食品安全领域，病毒检测技术的准确性与可靠性一直是科研人员关注的焦点。近期，一项结合了全基因组测序与RT-qPCR技术的新型病毒检测方法，为冷冻浆果中的食源性病毒检测提供了更精准的解决方案。这一方法不仅提升了检测的灵敏度，还能够对病毒进行全基因组分析，为病毒的溯源与防控提供了强有力的技术支撑。
技术解析
全基因组测序（Whole-Genome Sequencing，WGS）作为一种高通量测序技术，能够对样品中的病毒基因组进行深度测序。与传统的RT-qPCR（实时定量聚合酶链式反应）相比，WGS能够提供病毒的全基因组信息，这对于病毒的分类、进化分析以及新病毒的发现具有不可替代的优势。通过与RT-qPCR结果的结合，WGS能够对初步检测到的病毒进行确认，确保检测结果的准确性。
应用案例
在一项针对冷冻浆果的检测中，科研人员首先利用RT-qPCR快速筛查出可能含有食源性病毒的样品。随后，采用WGS对RT-qPCR检测出阳性的冷冻浆果样本进行深度测序。通过比对已知病毒基因组，不仅确认了RT-qPCR结果的准确性，还进一步分析了病毒的基因型和变异情况，为后续的病毒防控提供了重要信息。
图1 样品制备、RNA分离、PCR检测和全基因组测序的实验方法示意图
技术优势
相较于传统的单一RT-qPCR检测方法，全基因组测序与RT-qPCR结合的方法具有以下优势：
高灵敏度与特异性：RT-qPCR的快速筛查结合WGS的深度分析，确保了检测结果的准确性。
全基因组信息：WGS能够提供病毒的全基因组序列信息，为病毒的分类与溯源提供了可能。
适应性广泛：这一方法不仅适用于冷冻浆果，对于其他食品中的病毒检测同样有效。
结语
科技的进步不断推动着食品安全检测技术的革新。全基因组测序与RT-qPCR结合的方法，不仅为冷冻浆果中的食源性病毒检测提供了更精准的解决方案，也为其他食品病毒检测开辟了新的道路。未来，随着技术的不断成熟与应用，食品安全将得到更有力的保障，公众健康也将得到更全面的保护。
参考文献：Whole-Genome Sequencing-Based Confirmatory Methods on RT-qPCR Results for the Detection of Foodborne Viruses in Frozen Berries
来源：微生物安全与健康网，作者~蔡伟程。
